Analysis of interactions between cephalosporin and chloramphenicol-specific regulator and its effectors and DNA
Analiza oddziaływań regulatora odpowiedzi na cefalosporyny i chloramfenikol z efektorami i DNA
Project type: Research and development
Keywords: regulator transkrypcji rodzina TetR struktura przestrzenna mikroskalowa termoforeza
Keywords (english): transcription regulator TetR family spatial structure microscale thermophoresis
Consortium members: Project was not implemented as part of a consortium
Project implementation period: 5/10/2023 - 4/01/2025
Funding institution: Narodowe Centrum Nauki
Program name: MINIATURA
Project manager: Agnieszka Pietrzyk-Brzezińska
Funding value: 49 830,00 PLN
Total project value: 49 830,00 PLN
Celem niniejszego projektu jest analiza oddziaływań regulatora CecR z efektorami oraz z docelową sekwencją DNA rozpoznawaną przez to białko, a w rezultacie opracowanie metodyki do analizy takich oddziaływań w obrębie rodziny białek TetR. Badania wstępne zaplanowane w projekcie można podzielić na dwie części. Pierwsza część będzie obejmować badania biofizyczne mające na celu ustalenie powinowactwa efektorów (chloramfenikolu oraz wybranych cefalosporyn), a także docelowej cząsteczki DNA do regulatora CecR. Drugą część projektu będą stanowić badania strukturalne pozwalające na szczegółowy opis oddziaływań regulator-efektor oraz regulator-DNA na poziomie molekularnym.
The goal of the project is the analysis of interactions between the CecR regulator and their effectors or DNA sequence recognized by this protein. This will lead to the description of the methodology which can be further applied to other proteins belonging to the TetR family. The first part of the project will involve a biophysical analysis of the interactions between CecR and antibiotics or the DNA sequence, whereas the other part will be dedicated to structural studies of the CecR-effector and CecR-DNA complexes.
Go back